Ilman designaatiota olevia variantteja on myös omalla GITHUB- listallansa, esimerkkinä Suomestakin löytynyt BA.5.1*& Orf1b:V1271L

 https://cov-spectrum.org/explore/World/AllSamples/Past6M/variants?aaMutations=ORF1b%3AV1271L&nextcladePangoLineage=BA.5.1*&

Otan tämän mielenkiintoien esimerkin, koska tätä on  lähetetty myös Suomesta GISAID- listoille.

Yksi monen sadan näytteen  joukosta ilmentää runsaasti insertioita ja ne ovat myös sivulla mainittuna.  

Tämän päivän aktuelleissa GITHUB-asioissa  on luetteloa  niistä  BA.5.1.   alalinjoista  , joille ei ole omaa  designaatiotansa  ainakaan vielä.  

 

 

Tämän asian otsikko on #1135:  Collection of undesignated BA.5.1 diversity . Esimerkkinä oleva linja on  siitä luettelosta.

 Näistä kaikista  PANGO-uettelon puolella näkymättömistä ja  designaated-  luettelossa näkyvistä linjoista saa arvioitua prosentuaaliset osuudet siitä "100%:sta" mikä kuvaa aina sitä tilannetta, joka vallitsee.    Otsikon linkissä on vasemmassa sivustassa  taulukko, josta  nykytilanne näkyy prosentteina ja  kunkin variantin tai varianttiryhmän  summakäyrinä.

 

• Collection of undesignated BA.5.1 diversity

  #1135 opened 21 hours ago

• Collection of large, currently undesignated BA.5.2.1 diversity

  #1134 opened 21 hours ago 

  (Esimerkki Singaporessa ilmenevästä  variantista  BA.5.2.1* & ORF1a:A2784V, jolla ei ole vielä oman linjan designaatio-nimeä:
  

   https://cov-spectrum.org/explore/World/AllSamples/Past6M/variants?aaMutations=ORF1a%3AA2784V&nextcladePangoLineage=BA.5.2.1*&   )

  (Toinen esimerkki Ruotsissa ilmenevästä variantista BA5..2.1.*& ORF1b:G376S, jolla ei ole vielä oman linjan designaatio-nimeä:

  BA.5.2.1 + ORF1b:G376S, mostly Sweden and US, 5k seqs, https://cov-spectrum.org/explore/World/AllSamples/Past6M/variants?aaMutations=ORF1b%3AG376S&nextcladePangoLineage=BA.5.2.1*& )
  

   

• 
  
Collection of large BA.5.2 diversity

#1133 opened 21 hours ago