https://www.nature.com/articles/cddis2015313https://en.wikipedia.org/wiki/Neurogenin-3
Neurogeniini -3 on myös haiman endokriinisten solujen erilaistumisessa tärkeä kasvutekijä kuten PDx1 . Alkiossa se esiintyy ja runsaat 2 viikkoa munasolun hedelmöitymisen jälkeen. Aikuisella NGN3+ soluja esiintyy haimassa ja sitä merkkiä kantavat solut erilaistuvat saarekesoluiksi. NGN+ solut ovat kantasolutyyppiä, jolla on rajoittunut erilaistumiskyky, Ne ovat oligopotentteja vaikka vielä lopullsiesti erilaistumattomia ja niistä eteenpäin tapahtuu jokin kapeakirjoitenn erilaistuminen, kuen haimasaarekkeen eri solutyypit ( alfam beta, delta, pp).
Neurogeniini3 geenillä on seuraavia nimiä:
Aliases
NEUROG3, Atoh5, Math4B, NGN-3, bHLHa7, ngn3, neurogenin 3
Geenin sijaintikohta on kromosomi 10q22.1 .
Mitä tietoa on tästä NGN3 geenistä saatavilla?
Kerään näitä saarekesolun alkukehitykseen vaikuttavia geenejä tähän blogiin jonkin aikaa , koska diabetesterapiassa ollaan suuntautumassa ehkä ennaltaehkäisevään painotukseen ja geeniterapiaan ja kantasolun ohjelmointiin.
Katson ensiksi tämän wikitiedon suomeksi ja selittelen käsitteitä käsitykseni mukaan.
Suomennosta:
Neurogeniini-3 on valkuaisaine eli proteiini, jota ihmisellä koodaa geeni nimeltään NEUROG3. Sillä on muitakin nimiä. Sen sijainti kromosomistossa on kromosomissa 10, tarkempi sijaintiviiru on q22.1.
Tätä geeniä nähdään ilmenevän
neurogeniini-3 proteiinina sisäerityksellisissä (endokriinisissä) progeniittoreissa ja tämä proteiini on aivan välttämätön niissä, jotta haima (pancreas) ja ohutsuoli pystyy kehittymään ja kypsymään erilaisiin solumuotoihinsa.
Neurogeniini-3 kuuluu rakenteeltan
bHLH-transkriptiotgekijöihin (kts kuva) ja se osallistuu neuroektodermissä neuraalisten edeltäjäsolujen (solulinjan) määräämiseen.
- Neurogenin-3 is a protein that in humans is encoded by the NEUROG3 gene.[5]
- Neurogenin-3 is expressed in endocrine progenitor cells and is
required for endocrine cell development in the pancreas and intestine.[6] It belongs to a family of basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factors involved in the determination of neural precursor cells in the neuroectoderm.[7]
(Suomennosta): Normaalissa aikuishaimassa, sen akinaarisissa ja tiehytsoluissa, on 2-10% soluja joissa ilmenee tätä geeniä NGN3 ja sen koodaamaa proteiinia neurogeniini-3:a.
( Oma kommenttini:
Acinaarinen solu tuottaa ruoansulatusentsyymeitä ja niitä haima erittää tiehyeittensä kautta ja ne menevät suoleen, sekoittuvat maksasta tulevaan sappeen ja mahalaukun puoleta tuleviin tuotteisiin ja vaikuttavat ihmeellisesti ruoansulatuksen monipuoliseen hienosäätöön, että kaikenlainen ihmisen syömä tulee tarkasti hajoitettua alkumolekyyleihin, joita ikivanhat konservoidut genomisääteiset järjestelmät sitten ottavat talteen suolesta, Molekyylit imeytyvät ( absorboituvat) kehoon suolesta.
Tässä on luonnollisesti mahdollisuuksia älyperäisesti, kognitiivisesti, tukea haiman optimaalista kykyä sen resurssien mukaisesti, jotta sen toiminta voisi olla parhaimmillaan kaikin puolin. Esimerkisi pelkkä sokerin syöminen saattaisi olla kova rasitus- tai pelkkä rasvan syöminen, saati siten jokin orgaaninen liuotin tai toxiini, Saattaa olla että ruoka-aikojen merkitys on sen funktiolle myös tärkeä. Silläkin voi olla optimisyklinsä exogeenisissäkin erityksissä, Insuliinin suhteen niitä aikakäyriä onkin paljon).
Haiman (pancrfeas) nimi on
mahasylkirauhanen ja akinaariset solut tuottavat sitä mahasylkeä. (Mutta insuliini tuottuu saarekesoluista ja insuliini menee vereen, sen takia betasolut ja muut saarekesolut ovat
endokriinisiä, sisäerityssoluja).
Haiman erikoisuus on tämä: Se erittää vahvasti exokriinistä ja endokriinistä aivan vitaalisti. Miten se on rakentunut että se pystyy näin tekemään tuhoutumatta? ja toisaalta - jos se tuhoutuu, sitä ei voi helposti korjata. Siinä on yksi ihmisen heikoimpia kohtia. Haimaa ei voi edes siirtää, kuten maksaa tai keuhkoa tai sydäntä. Lisäksi sen sijoittuminen on erikoisen hankala jos ajatellaan kirurgien kannalta.
- Neurogenin 3 (NGN3) is expressed by 2-10% of acinar and duct cells in
the histologically normal adult human pancreas.
Sellaiset koeputkessa viljellyt exokriinisen haimankudoksen
NGN3+solut, joissa ilmenee myös klusteritekijä
CD133+, ovat transkriptomiltaan exokriinisiä vaikka jo hieman valiutuneita, mutta vielä lopullisesti erilaistumattomia soluja ja ne muistuttavat kehityksenaikaista
endokriiniä pancreas-progeniittorisolua ja niillä on koeputkessa kapasiteettia endokriiniseen erilaistumiseen ( eli niistä voi tulla, alfa, beta, delta ja PP soluja ( tarpeen mukaan), (kaikkia saarekesoluja)
- NGN3+ cells isolated
from cultured exocrine tissue by coexpressed cell surface glycoprotein
CD133 have a transcriptome consistent with exocrine dedifferentiation, a
phenotype that resembles endocrine progenitor cells during development,
and a capacity for endocrine differentiation in vitro.[8]
On voitu uudelleen ohjelmoida sekä ihmisen että koe-eläimen (jyrsijälajin kuten hiiren) exokriinisiä haimasoluja sellaisiksi soluiksi, joissa on tyypillinen saarekesolun fenotyyppi. Näitä on saatu viljeltyä sellaisesta solulinjasta joka on ilmentänyt NGN3 geeniä tai joita on käsitelty niin , että ne on saatu ilmetämään NGN3+.
- Human[9] and rodent[10][11][12][13][14][15][16][17][18]
exocrine cells have been reprogrammed into cells with an islet
cell-like phenotype following direct expression of NGN3 or manipulation
that leads to its expression.
Muistiin 14.2. 2018 :
NGN3 , neurogeniini 3.
Näitä merkitsijöitä, joilla solulinjoja voi havaita, on paljon. koetan kerätä niitä tähän blogiin.
(Seuraavaksi ajattelen katsoa NKX6 geeniä
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21947380 )
Tarkistan ensin tässä mikä erilaistumisklusteritekijä tuo Cluster of Differentiation CD133 on. Mitä se merkitsee erilaistumisessa?
https://en.wikipedia.org/wiki/CD133
Sillä on oma geeninsä
PROM1
Geeni sijaitsee kromosomissa 4p15.32 ja sitä on useissa aikuiskantasoluissa ja se vaikuttaa suppressoivan, vaimentavan differentioitumista, siis pitää yllä sillä hetkellä olevaista kantasolufunktiota ( esim selektiivisesti oligopotenttia) ja vaimentaa erilaistumistrendiä. Sitä näyttää mainitun
onkologian alueelta.
PubMed lähteestä tietoa: hakusanana Gene PROM1
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/8842#gene-expression
- Official
Symbol
- PROM1provided by HGNC
- Official
Full Name
- prominin 1provided by HGNC
- Gene type
- protein coding
- RefSeq status
- REVIEWED
- Organism
- Homo sapiens
- Also known as
- RP41; AC133; CD133; MCDR2; STGD4; CORD12; PROML1; MSTP061
- Summary
- This gene encodes a pentaspan transmembrane glycoprotein.
The protein localizes to membrane protrusions and is often expressed on
adult stem cells, where it is thought to function in maintaining stem
cell properties by suppressing differentiation. Mutations in this gene
have been shown to result in retinitis pigmentosa and Stargardt disease.
Expression of this gene is also associated with several types of
cancer. This gene is expressed from at least five alternative promoters
that are expressed in a tissue-dependent manner. Multiple transcript
variants encoding different isoforms have been found for this gene.
[provided by RefSeq, Mar 2009]
- Expression
- Broad expression in gall bladder (RPKM 15.7), stomach (RPKM 10.2) and 18 other tissues See more
(PS. Tässä huomaan mainitun
retinitis pigmentosan. Sikäli tämä kiinnostaa, koska yliopistossa kun meillä oli suomen kielen kirjallisen osaamisen testi, sain tehtäväksi kirjoittaa esitelmän silmätautien alasta
retinitis pigmentosa professori Zewin kurssilla. Siihen aikaan ei tiedetty taustasyitä siihen).
Näyttää olvan aika tärkeä asia tuo CD133.
Otan kopion artikkeleistakin tähän. se on laajavaikutuksinen onkologiassa, silmän verkkokalvon patologiassa, lääke-multiresistenssiä, sädehoitoresistenssissä, normaalin saarekesoluiksi erilaistuvan solun täytyy siis vasta-vaikuttaa CD133-säätelyyn joko vähentämällä sitä tai sen vaikutusta.
Related articles in PubMed
-
Cytoplasmic expression of CD133 stemness marker is associated with tumor aggressiveness in clear cell renal cell carcinoma.
Saeednejad Zanjani L, et al. Exp Mol Pathol, 2017 Oct. PMID 29050853
-
Prominin-1 Is a Novel Regulator of Autophagy in the Human Retinal Pigment Epithelium.
Bhattacharya S, et al. Invest Ophthalmol Vis Sci, 2017 Apr 1. PMID 28437526, Free PMC Article
-
Epigenetic Regulation of CD133 in Gastrointestinal Stromal Tumors.
Geddert H, et al. Am J Clin Pathol, 2017 May 1. PMID 28398518
-
Polymorphisms of cancer stem cell marker gene CD133 are associated with susceptibility and prognosis of gastric cancer.
Jia ZF, et al. Future Oncol, 2017 May. PMID 28326835
-
Sulfasalazine attenuates evading anticancer response of CD133-positive hepatocellular carcinoma cells.
Song Y, et al. J Exp Clin Cancer Res, 2017 Mar 3. PMID 28253902, Free PMC Article
-
Results
show that CD133 and MDR1 expression increase in recurrent pediatric
pilocytic astrocytomas (PAs) following chemotherapy, and in drug
resistant tumor cells. CD133 regulates MDR1 expression via the
PI3K/AKT/NF-kappaB signaling. These results provide evidence that CD133
contributes to multidrug resistance by regulating MDR1 levels via the
PI3K-Akt-NF-kappaB signal pathway.
-
CD133(+)
CD44(+) CD54(+) cellular subpopulation of circulating tumor cells has a
prognostic value in colorectal cancer patients with liver metastasis,
especially in the survival of CRC patients with liver metastasis who did
not undergo surgical treatment for metastasis.
-
High CD133 expression is associated with radioresistance in liver cancer.
-
CD133+ glioblastoma cells express molecular signatures of MSCs, neural stem cells and pluripotent stem cell
-
These findings indicate a novel potential anti-tumor mechanism for tubacin in CD133-expressing malignancies.
( http://www.musechem.com/product/I003961.html )
-
CD133 expression in colonic liver metastases is a negative prognostic factor for disease-free survival after liver resection.
-
The study found a significant association between the SNP rs2240688A[C of CD133 and lung cancer risk.
-
Results
strongly indicate functional roles for CD133 in reactive oxygen species
defense and in evading anticancer therapies in hepatocellular
carcinoma.
-
High CD133 expression is associated with clear cell renal cell carcinoma.
-
This
study described three cases in which variations in PROM1 gene may play a
role in the pathogenesis of macular dystrophy or be associated with
both autosomal recessive and autosomal dominant inheritance.
Muistiin 12:22
Paitsi että
tuli mieleen katsoa myös CD133 vaikutuksen vähentämismekanismi.
Hakusana: CD133 suppressing?
https://www.nature.com/articles/cddis2015313
Transcriptional repression of cancer stem cell marker CD133 by tumor suppressor p53
E K Park, J C Lee et al.
Tässä näyttää taas tulevan vastaan genominsuojelumekanismit ja siksi TRIM järjestelmää täytyy selvittää edelleen, koska se on interaktiossa p53- järjestelmään. Tässä haima taas on erikoinen, koska p53 signalointi on hyvin alasäätöinen haimassa. Saattaa sinänsä olla eduksi, JOS oligopotentti progeniittori on jo muodostunut. Taitaa olla jokin vaihdekohta, joka on kriittinen saarekesolujen erilaistumisen ja loppuun sti kypsymisen suhteen. ehkä koko haiman koon suhteen, koska en kyllä ole kuullut sellaisesta että ihminen koskaan olisi "haimaltaan lihava", vaikka ylipainoa muuten olisi yhdessä sun toisessa elimessä. Ja jos betasolut laihtuvat, eli katoavat, haiman kokokin kutistuu ja katoaa.
Käsittääkseni ei ole tervettä haimaa jossa olisi sairaat saarekkeet. eikä sairaita saarekkeita ilman josain suhteessa sairasta haimaa.
